隨后，賀耘成為香港中文大學的一名博士生。1990年，他離開香港前往美國愛荷華州立大學繼續(xù)自己的求學之路，先后獲得愛荷華州立大學有機合成專業(yè)碩士學位、加利福尼亞州克銳普斯研究所有機合成專業(yè)博士學位。并相繼在跨國企業(yè)雅培、諾華、羅氏，以及美國生物科技公司(IONIS)和國際知名醫(yī)藥外包公司(PPD)等全球知名醫(yī)藥企業(yè)擔任重要職務。

　　2004年起，賀耘兼任中美生物技術與制藥協(xié)會(SABPA)科技委員會主席、理事、會長、全球聯(lián)絡委員會主席。雖長年旅居海外，但賀耘從沒有斷了對國內(nèi)醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)發(fā)展的關注。

　　2006年，賀耘做了一個人生中重大的決定，在國外待了16年后，他毅然決定回到國內(nèi)發(fā)展，這意味著他放棄了在美國穩(wěn)定舒適的生活、高薪的職位。他的親朋好友中很多人對他的這個決定不解，賀耘說：“中國人在國外待了這么久，是該回來做點事了?！?/p>

　　有差距恰好說明有潛力 他回鄉(xiāng)參與創(chuàng)辦藥學院

　　回國后，賀耘先是在上海呆了2年，又在北京待了4年，當時正值國內(nèi)生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)發(fā)展迅速，前景廣闊，亟需醫(yī)藥研究專業(yè)人才。賀耘在京滬兩地的國際知名藥企擔任重要職位，將多年國外所學在國內(nèi)大展拳腳，并積累了豐富的新藥研發(fā)和高層科研管理經(jīng)驗。

　　2012年，賀耘又做了一個重大決定，回故鄉(xiāng)重慶，參與創(chuàng)辦重慶大學藥學院，并擔任首任院長。

　　重慶大學藥學院的前身是2011年成立的創(chuàng)新藥物研究中心。該中心成立時，賀耘曾作為中心的特聘顧問。重慶大學時任校長林建華、理學部主任吳云東院士與賀耘懇談過多次，向他透露想要創(chuàng)建藥學院的想法。

　　說起在臨近知天命的年紀回到故鄉(xiāng)開創(chuàng)新的事業(yè)，賀耘表示，除了盛情難卻，更主要的是他看中重慶在生物醫(yī)藥創(chuàng)新方面的巨大潛力。

　　賀耘說，重慶曾是全國五大老醫(yī)藥工業(yè)基地之一，不僅化學醫(yī)藥具備較強的生產(chǎn)能力和技術積累，中藥產(chǎn)業(yè)也特色明顯，說明在醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)方面有很好的基礎。但是，從科研氛圍、醫(yī)藥創(chuàng)新等大環(huán)境來說，跟國外和北京、上海這些國內(nèi)大城市比起來，還是有差距。而正因為有差距，反而說明更有機會和潛力，對他來說，則意味著有更大的施展才能的空間。